112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2883 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  70.77 
 
 		 416 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  73.23 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  70.76 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  71.66 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  72.85 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  71.31 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  68.85 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  69.4 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 380 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  36.84 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  38.32 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  36.84 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  31.58 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  31.44 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  30.59 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  31.95 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  29.02 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  26.12 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  29.7 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  29.78 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  30.92 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  28.99 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  25.2 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  28.65 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  26.15 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  27.62 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  27.62 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  27.62 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  27.64 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  42.42 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  42.42 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  30.85 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  27.84 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  30.16 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  22.42 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  29.38 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  25.55 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  26.57 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  25.27 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0330  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.422618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  28.18 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  29.5 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  25.56 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  26.99 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  34.53 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  29.18 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  35.66 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  25.71 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  38.32 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  28.32 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  31.23 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  34.97 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  28.18 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1997  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  28.17 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  35.66 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  29.79 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  26.7 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  21.68 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  27.78 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>