146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0515 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  755    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  32.63 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  29.72 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2400  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2447  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.118578  normal  0.46629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2441  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3025  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  29.37 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  29.37 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  29.37 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  23.51 
 
 		 400 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  25.71 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  24.43 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  24.35 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  26.41 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  24.35 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  24.35 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  22.25 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.92 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  23.99 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  27.49 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  27.49 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  28.48 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  27.49 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  27.49 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  27.49 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  27.49 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  27.49 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  27.49 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  28.26 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  28.26 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  28.26 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  28.26 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  28.26 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.98 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  29.71 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  27.93 
 
 		 456 aa  47.4  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  28.52 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  27.83 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  28.52 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  28.52 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  28.52 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  28.52 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  26.96 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  24.23 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  25.96 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  25.96 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  25.96 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  25.96 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  25.96 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  27.78 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 434 aa  46.6  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 393 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  25.3 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  26.55 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  24.6 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  25.3 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>