More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2581 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  100 
 
 		 402 aa  801    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  801    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  92.54 
 
 		 402 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  100 
 
 		 402 aa  801    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  92.54 
 
 		 402 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  92.54 
 
 		 402 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  86.32 
 
 		 402 aa  678    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  99.75 
 
 		 402 aa  799    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  92.54 
 
 		 402 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  99.75 
 
 		 402 aa  799    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  99.75 
 
 		 402 aa  799    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  801    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  100 
 
 		 402 aa  801    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  99.75 
 
 		 402 aa  799    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  92.54 
 
 		 402 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  81.12 
 
 		 401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  75.69 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  75.69 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  80.61 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  75.69 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  78.17 
 
 		 401 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  74.23 
 
 		 401 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  74.87 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  71.17 
 
 		 411 aa  549  1e-155  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 408 aa  255  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 406 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  29.32 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  24.09 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  24.09 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  24.35 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.36 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  28.98 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.55 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24.09 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.83 
 
 		 393 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  24.81 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  23.27 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 477 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  25 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.8 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 424 aa  86.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.43 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.28 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.23 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.16 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.22 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  23.71 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.75 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.7 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.35 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.92 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.4 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.8 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  20.58 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.49 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>