267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1368 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  802    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  34.32 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 414 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 427 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  29.2 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  27.4 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.19 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  26.94 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  24.55 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  26.79 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.2 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.88 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  30.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  28.16 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  24.4 
 
 		 417 aa  57  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  27.34 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 219 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  27.53 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 457 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  25.62 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  21.99 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  21.99 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 474 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 406 aa  53.5  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 474 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.85 
 
 		 440 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 474 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2261  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  23.92 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  26.43 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  23.14 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  22.88 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>