39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3349 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  780    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  57.28 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  53.12 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  51.62 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 		 415 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  45.96 
 
 		 400 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 405 aa  269  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  36.9 
 
 		 391 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  37.64 
 
 		 393 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  36.69 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 408 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  30.49 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  25.87 
 
 		 503 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  30.47 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 452 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 444 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>