94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4177 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  795    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  52.99 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 411 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  53.38 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  54.94 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 399 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  36.57 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  35.16 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  34.1 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 386 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  29.93 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 408 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 432 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.4 
 
 		 509 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  28 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  25.92 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  26.63 
 
 		 492 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  23.56 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  23.56 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.52 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  23.56 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  25.63 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  23.56 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  25.63 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  23.03 
 
 		 465 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  21.09 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  28.87 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  24.21 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  22.37 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  25.63 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  28.17 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  28.17 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  28.17 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  28.17 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 456 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.21 
 
 		 551 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 472 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  27.22 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 472 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 472 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 472 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 472 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 445 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 446 aa  42.7  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>