94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4836 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  807    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  50.62 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 405 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  52.83 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 415 aa  292  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  49.14 
 
 		 399 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  38.46 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 391 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  36.08 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  39.36 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 391 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.18 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  25 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  24.7 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  25.16 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  27.14 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.78 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  24.84 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.93 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.93 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5632  general substrate transporter  27.14 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2458  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  27.14 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  32.88 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6488  general substrate transporter  27.14 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.93 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  27.14 
 
 		 552 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.93 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.93 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.93 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.93 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  27.14 
 
 		 531 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  27.14 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  35 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.11892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  26.13 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  25.35 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7406  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  26.63 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  33.56 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  26.13 
 
 		 527 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  26.63 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.93 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  26.63 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  29.9 
 
 		 1072 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  25.89 
 
 		 491 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 477 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>