49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4993 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  769    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  53.75 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  53.12 
 
 		 406 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 411 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  46.67 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  45.94 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  48.2 
 
 		 423 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  40.17 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  40.62 
 
 		 393 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  39.51 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  29.62 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  25 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.91 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  23.89 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0043  major facilitator family transporter  31.75 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.768707  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0037  major facilitator family transporter  34.11 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.729938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 474 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.68 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 474 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 474 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0160  general substrate transporter  29.59 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 473 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>