32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1044 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  100 
 
 
396 aa  756    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  71.32 
 
 
400 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  59.95 
 
 
391 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  63.51 
 
 
401 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  51.56 
 
 
395 aa  312  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  53.65 
 
 
388 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  55.28 
 
 
391 aa  293  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  53.65 
 
 
391 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  45.18 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  43.98 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  40.27 
 
 
408 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  35.04 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
415 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
391 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  37.59 
 
 
399 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  38.23 
 
 
411 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  38.07 
 
 
400 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  38.23 
 
 
411 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  37.66 
 
 
406 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 
423 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  35.6 
 
 
405 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  27.3 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  30.28 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
415 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  40 
 
 
448 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  40 
 
 
448 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  40 
 
 
448 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>