128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3400 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  749    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  62.95 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  49 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  43.78 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 391 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  46.18 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  44.27 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 415 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 423 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  35.26 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  28.34 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  26.92 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.17 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2286  major facilitator family transporter  30.95 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  27.62 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  27.62 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 442 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  23.53 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  23.41 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  25.66 
 
 		 549 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  26.49 
 
 		 475 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  23.62 
 
 		 463 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  25.71 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  23.12 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  31.14 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  28.65 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  25.71 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  25.71 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 448 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  25.77 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  23.12 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  26 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  26 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  26 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  26 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  23.12 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  23.17 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>