More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0532 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  100 
 
 
436 aa  850    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
436 aa  849    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  88.76 
 
 
436 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  65.52 
 
 
436 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  68.89 
 
 
437 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  57.08 
 
 
526 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  55.91 
 
 
438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  55.25 
 
 
437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  55.3 
 
 
438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  47.26 
 
 
464 aa  325  7e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  42.34 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
451 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  34.68 
 
 
447 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
473 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.57 
 
 
399 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.52 
 
 
399 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.76 
 
 
399 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.76 
 
 
399 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.29 
 
 
399 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
435 aa  229  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.52 
 
 
399 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.52 
 
 
399 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.52 
 
 
399 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.52 
 
 
399 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.29 
 
 
399 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  33.57 
 
 
399 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 
445 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
398 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  36.08 
 
 
485 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.81 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  40.21 
 
 
477 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  36.04 
 
 
438 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.59 
 
 
455 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 
451 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  39.73 
 
 
449 aa  211  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.37 
 
 
457 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.58 
 
 
459 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  33.49 
 
 
422 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  33.79 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  33.87 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
404 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  37.1 
 
 
381 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  32.33 
 
 
509 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.58 
 
 
474 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.47 
 
 
476 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.9 
 
 
474 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.9 
 
 
474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.55 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  28.92 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.19 
 
 
473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.25 
 
 
474 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 
456 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.12 
 
 
478 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.12 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.14 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
472 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.61 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.6 
 
 
467 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  31.25 
 
 
461 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
450 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  33.42 
 
 
382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  33.59 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  29.09 
 
 
388 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
447 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.77 
 
 
468 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
380 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  33.25 
 
 
450 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 
446 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  30.95 
 
 
465 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  33.42 
 
 
434 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.85 
 
 
464 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  30.48 
 
 
576 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
446 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
459 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  31.1 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  32.49 
 
 
398 aa  147  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  31.64 
 
 
469 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  28.18 
 
 
579 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.289204 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46251  predicted protein  29.54 
 
 
564 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  32.02 
 
 
435 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.49 
 
 
468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  31.22 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
423 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  29.76 
 
 
514 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  29.73 
 
 
481 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
454 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45672  predicted protein  28.26 
 
 
557 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>