More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45672 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45672  predicted protein  100 
 
 
557 aa  1139    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_2917  MFS family transporter  32.26 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  29.43 
 
 
438 aa  183  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  27.84 
 
 
526 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 
438 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  29.02 
 
 
437 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  30.77 
 
 
459 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  29.95 
 
 
436 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  30.41 
 
 
576 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
436 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
436 aa  147  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  29.5 
 
 
437 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.82 
 
 
447 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  29.29 
 
 
436 aa  140  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.82 
 
 
455 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  29.77 
 
 
464 aa  133  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
451 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.45 
 
 
455 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46251  predicted protein  26.27 
 
 
564 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.42 
 
 
470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.67 
 
 
438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.09 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  27.29 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
451 aa  113  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.32 
 
 
459 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
445 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  26.56 
 
 
382 aa  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  25.67 
 
 
476 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  25.85 
 
 
473 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.92 
 
 
474 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  26.53 
 
 
477 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  25.91 
 
 
473 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  26.18 
 
 
461 aa  104  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  25.06 
 
 
478 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.68 
 
 
474 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
447 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.15 
 
 
399 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.8 
 
 
468 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
451 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.68 
 
 
474 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
435 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
399 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
399 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
399 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  25.47 
 
 
456 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.1 
 
 
434 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
399 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.15 
 
 
399 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.15 
 
 
399 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.15 
 
 
399 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
399 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
478 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
478 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
399 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
478 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  25 
 
 
478 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  24.82 
 
 
478 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
478 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
398 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
539 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  27.16 
 
 
449 aa  99.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.78 
 
 
478 aa  98.2  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.99 
 
 
399 aa  97.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
456 aa  97.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  24.88 
 
 
474 aa  97.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  25.27 
 
 
446 aa  95.9  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.62 
 
 
480 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  23.98 
 
 
476 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.16 
 
 
459 aa  94.7  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  25.33 
 
 
422 aa  94.4  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  27.23 
 
 
441 aa  94.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.56 
 
 
464 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
460 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  27.49 
 
 
450 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
446 aa  90.9  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
472 aa  90.5  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  24.52 
 
 
467 aa  90.1  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.65 
 
 
463 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.28 
 
 
487 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.36 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
404 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
467 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
467 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
398 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  24.94 
 
 
465 aa  87.4  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
465 aa  87.4  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.12 
 
 
445 aa  87  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  26.04 
 
 
435 aa  87  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25.51 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  26.73 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  27.79 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  26.5 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  25 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  27.25 
 
 
468 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  27.72 
 
 
450 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  25.11 
 
 
507 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>