More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5470 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  100 
 
 
461 aa  925    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  50.67 
 
 
442 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  48.97 
 
 
435 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.32 
 
 
447 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
451 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.15 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  30.36 
 
 
436 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  32.05 
 
 
459 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
436 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.61 
 
 
438 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
436 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.16 
 
 
474 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.86 
 
 
474 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.07 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  30.75 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.16 
 
 
474 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.36 
 
 
473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.11 
 
 
473 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
473 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.38 
 
 
455 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
435 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.59 
 
 
456 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.68 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  29.14 
 
 
485 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.25 
 
 
450 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  32.12 
 
 
436 aa  153  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.54 
 
 
474 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.54 
 
 
457 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.04 
 
 
459 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
472 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
447 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  29.93 
 
 
437 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  29.95 
 
 
381 aa  150  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.69 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.64 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  27.55 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  27.19 
 
 
526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
451 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
478 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
478 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
478 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  26.78 
 
 
382 aa  144  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.91 
 
 
478 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
478 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
478 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
478 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  26.77 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.32 
 
 
438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  31.45 
 
 
415 aa  141  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
398 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.16 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  26.94 
 
 
464 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
470 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  28.51 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
456 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  27.23 
 
 
425 aa  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  27.44 
 
 
509 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.94 
 
 
463 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.49 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
399 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  27.77 
 
 
462 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
399 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  27.86 
 
 
451 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.22 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
398 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.07 
 
 
432 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  27.54 
 
 
462 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  26.39 
 
 
422 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  26.39 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.07 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.85 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.19 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.24 
 
 
433 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
404 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  26.48 
 
 
432 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
459 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.07 
 
 
433 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.83 
 
 
432 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  27.01 
 
 
432 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.01 
 
 
433 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.83 
 
 
432 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.83 
 
 
433 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
465 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  26.12 
 
 
422 aa  124  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
432 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  28.94 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  28.94 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.9 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>