More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1266 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  99.29 
 
 		 422 aa  827    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  832    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  53.65 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  35.21 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  34.25 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.71 
 
 		 526 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  31.6 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  31.95 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  32.74 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  34.68 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 451 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  33.69 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.07 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.76 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.79 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 474 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.47 
 
 		 468 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 474 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  29.31 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.76 
 
 		 476 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 465 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.74 
 
 		 478 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.22 
 
 		 472 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.64 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  26.99 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  27.2 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  28.08 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 514 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.56 
 
 		 478 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  27.23 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 465 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 465 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>