More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5083 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  840    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  68.89 
 
 		 436 aa  597  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  68.89 
 
 		 436 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  67.9 
 
 		 436 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  66.59 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  56.62 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  56.56 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  56.29 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  58.18 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 447 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  38.39 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.44 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 398 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  38.02 
 
 		 477 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  34 
 
 		 457 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  35.62 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.9 
 
 		 485 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.84 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.92 
 
 		 455 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 451 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.65 
 
 		 472 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 474 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 473 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.71 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 473 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.03 
 
 		 476 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.11 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.88 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.88 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.8 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 415 aa  179  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 456 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.52 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  29.33 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  35.29 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 446 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.98 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.85 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  31.25 
 
 		 469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45672  predicted protein  29.5 
 
 		 557 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 514 aa  143  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  29.44 
 
 		 576 aa  142  9e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.72 
 
 		 474 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  28 
 
 		 579 aa  136  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.289204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.72 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  30.13 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>