More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4040 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  100 
 
 
435 aa  845    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  48.97 
 
 
461 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  50.81 
 
 
442 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  34.87 
 
 
459 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
451 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.65 
 
 
464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.72 
 
 
438 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.34 
 
 
447 aa  170  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
447 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  32.35 
 
 
467 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.85 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.6 
 
 
476 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.95 
 
 
459 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.11 
 
 
474 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
451 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.11 
 
 
474 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.17 
 
 
474 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.11 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.98 
 
 
478 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.98 
 
 
478 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.98 
 
 
478 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.98 
 
 
478 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.98 
 
 
478 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.98 
 
 
478 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.76 
 
 
478 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
445 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.62 
 
 
455 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 
473 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.92 
 
 
472 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.76 
 
 
455 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
472 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.36 
 
 
473 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  31.66 
 
 
436 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  32.09 
 
 
477 aa  156  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  31.66 
 
 
436 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.27 
 
 
457 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
436 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
436 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.92 
 
 
526 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
456 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.28 
 
 
485 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  30.79 
 
 
437 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  30.25 
 
 
438 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  29.73 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
465 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  36.29 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.87 
 
 
456 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.28 
 
 
381 aa  146  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  29.85 
 
 
399 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.75 
 
 
399 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.5 
 
 
399 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.5 
 
 
399 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.41 
 
 
438 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
399 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
399 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.5 
 
 
399 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
399 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
399 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.5 
 
 
399 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.32 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.41 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
458 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  28.82 
 
 
382 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
398 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.43 
 
 
485 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.2 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  30 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.57 
 
 
485 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  28.22 
 
 
478 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  28.45 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  29.17 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  29.17 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.4 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.15 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  30 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  30 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  29.17 
 
 
451 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  29.17 
 
 
451 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.84 
 
 
449 aa  127  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  29.17 
 
 
451 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  29.17 
 
 
451 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  31.35 
 
 
468 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  29.98 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  29.17 
 
 
451 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.06 
 
 
487 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  29.81 
 
 
461 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  30.89 
 
 
474 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  30.82 
 
 
468 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  30.89 
 
 
474 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  30.82 
 
 
468 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  30.82 
 
 
468 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  30.82 
 
 
468 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
459 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  26.7 
 
 
487 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>