More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1683 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  100 
 
 
415 aa  788    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
451 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  38.89 
 
 
447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
398 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  39.47 
 
 
438 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  35.75 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  35.9 
 
 
399 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  35.9 
 
 
399 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
399 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
399 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
399 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
399 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
399 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.54 
 
 
399 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.54 
 
 
399 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 
398 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  34.23 
 
 
399 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  37.29 
 
 
474 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  37.23 
 
 
474 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  36.9 
 
 
474 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  37.05 
 
 
474 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  36.75 
 
 
473 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
451 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 
472 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.41 
 
 
472 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  36.38 
 
 
459 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
451 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  35.54 
 
 
459 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  35.6 
 
 
478 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  35.6 
 
 
478 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  35.6 
 
 
478 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  35.6 
 
 
478 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  35.6 
 
 
478 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  36.32 
 
 
455 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  36.17 
 
 
476 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
478 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  35.36 
 
 
478 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  36.09 
 
 
455 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  36.58 
 
 
473 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  35.87 
 
 
467 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  33.41 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  38.93 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
456 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.44 
 
 
485 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
404 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  34.05 
 
 
422 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
470 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  33.81 
 
 
422 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.5 
 
 
457 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
445 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  37.25 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 
435 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  30.71 
 
 
422 aa  200  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.61 
 
 
449 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  35.14 
 
 
382 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
380 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  36.24 
 
 
382 aa  190  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  34.88 
 
 
372 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  29.88 
 
 
388 aa  189  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  32.82 
 
 
509 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  35.81 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  39.88 
 
 
514 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  34.13 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  31.21 
 
 
438 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  35.81 
 
 
464 aa  176  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  34.87 
 
 
436 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  30.3 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  33.51 
 
 
526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.48 
 
 
468 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  34.13 
 
 
436 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  33.1 
 
 
437 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  33.89 
 
 
436 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.77 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
455 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.02 
 
 
454 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
458 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
467 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
467 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  36.36 
 
 
435 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  30.9 
 
 
461 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
447 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  27.57 
 
 
454 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
439 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
439 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  29.35 
 
 
448 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  26.89 
 
 
436 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  26.89 
 
 
433 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  26.89 
 
 
433 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  30.41 
 
 
456 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  26.89 
 
 
433 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  26.93 
 
 
433 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
446 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.28 
 
 
464 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.02 
 
 
451 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  26.63 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>