More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46251 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46251  predicted protein  100 
 
 
564 aa  1143    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  30.29 
 
 
459 aa  163  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.47 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.91 
 
 
455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.57 
 
 
447 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.69 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  30.23 
 
 
464 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
436 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
436 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
451 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.87 
 
 
438 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
447 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  26.65 
 
 
526 aa  140  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.9 
 
 
457 aa  140  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.22 
 
 
474 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.63 
 
 
459 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.22 
 
 
474 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.67 
 
 
472 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.49 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.22 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.22 
 
 
473 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  27.59 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.91 
 
 
476 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  27.08 
 
 
437 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.34 
 
 
438 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  27.36 
 
 
436 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.41 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.38 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  29.14 
 
 
485 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 
451 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.84 
 
 
478 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.84 
 
 
478 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
478 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
478 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
478 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  27.41 
 
 
478 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.47 
 
 
467 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
470 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
398 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.35 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.28 
 
 
399 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45672  predicted protein  26.63 
 
 
557 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.72 
 
 
399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  28.85 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  26.77 
 
 
437 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.13 
 
 
446 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
445 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
435 aa  110  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
465 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
442 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.26 
 
 
485 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  26.79 
 
 
451 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.83 
 
 
487 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  24.18 
 
 
424 aa  102  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  28.32 
 
 
398 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  26.26 
 
 
479 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
454 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  25.86 
 
 
422 aa  100  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  25 
 
 
479 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
380 aa  100  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  26.59 
 
 
576 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.286894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  27.86 
 
 
509 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.35 
 
 
487 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.64 
 
 
485 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.64 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  30.05 
 
 
465 aa  97.8  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  24.43 
 
 
452 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
450 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  28.13 
 
 
487 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  26.21 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  28.13 
 
 
487 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  26.68 
 
 
442 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  27.59 
 
 
437 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 
539 aa  94  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.02 
 
 
462 aa  93.6  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  26.15 
 
 
449 aa  93.2  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  26.22 
 
 
455 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  27.15 
 
 
450 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  27.45 
 
 
456 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  24.7 
 
 
422 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
477 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  26.18 
 
 
428 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  24.7 
 
 
422 aa  90.5  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
473 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>