30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3632 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
391 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  61.26 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  60.84 
 
 
400 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  62.24 
 
 
401 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  56.04 
 
 
391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  51.5 
 
 
388 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  52 
 
 
395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  53.41 
 
 
391 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  47.91 
 
 
386 aa  269  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  45.61 
 
 
393 aa  246  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  44.48 
 
 
408 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  39.66 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  39.9 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 
391 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  37.98 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  37.98 
 
 
411 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  36.9 
 
 
406 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  34.45 
 
 
405 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 
414 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  36.9 
 
 
405 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
423 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  29.54 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  27.25 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
417 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  25.57 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>