More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3501 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  837    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  39.38 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 417 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  29.47 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  26.94 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  26.77 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  27.87 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  27.24 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  24.39 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  23.26 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  27.16 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  29.45 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>