56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1751 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  757    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  62.24 
 
 		 391 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  63.51 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  66.32 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  53.91 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  57.81 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  53.32 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  55.01 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  48.3 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  46.18 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  47.18 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  40.12 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  40.9 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  26.74 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  23.83 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  23.83 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  23.83 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  23.83 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  27.67 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  31 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  25.93 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>