67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2330 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  100 
 
 
386 aa  725    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  48.31 
 
 
388 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  50.41 
 
 
391 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  47.91 
 
 
391 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 
400 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  50 
 
 
391 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 
401 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  45.36 
 
 
395 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  45.18 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  43.48 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  41.74 
 
 
408 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  38.56 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  38.27 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  37.53 
 
 
411 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  37.26 
 
 
411 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
415 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  33.69 
 
 
405 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  36.39 
 
 
406 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
423 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  33.25 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  24.63 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  27.25 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  21.79 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  35.79 
 
 
449 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.52 
 
 
405 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  22.1 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  21.79 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  21.74 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  21.74 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  21.79 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  21.74 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  21.74 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  21.74 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  21.43 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  21.74 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21441  predicted protein  28.41 
 
 
416 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  25.83 
 
 
483 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.8 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  25.13 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  29.7 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  29.7 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  28.57 
 
 
425 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  25.96 
 
 
394 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  30.7 
 
 
433 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  30.7 
 
 
432 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  30.39 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
539 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  30.7 
 
 
432 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  30.7 
 
 
432 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  30.7 
 
 
433 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  29.47 
 
 
450 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.82 
 
 
433 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.82 
 
 
433 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.82 
 
 
432 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.82 
 
 
432 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3530  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  29.14 
 
 
464 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
329 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>