More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3530 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3530  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  100 
 
 
464 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2748  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.54 
 
 
450 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.3 
 
 
465 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.86 
 
 
451 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.29 
 
 
451 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.29 
 
 
451 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.29 
 
 
451 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.29 
 
 
451 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.29 
 
 
451 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.29 
 
 
451 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.29 
 
 
451 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  33.04 
 
 
452 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  33.04 
 
 
452 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  34.43 
 
 
468 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.19 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  33.56 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  32.1 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.21 
 
 
475 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  34.37 
 
 
579 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  33.41 
 
 
453 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  34.97 
 
 
447 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.64 
 
 
453 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  32.41 
 
 
449 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3242  major facilitator transporter  31.18 
 
 
449 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.26 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  34.73 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  34.49 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4921  major facilitator transporter  30.95 
 
 
449 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.6 
 
 
454 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.26 
 
 
454 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.44 
 
 
441 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.64 
 
 
455 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  33.57 
 
 
453 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  35.21 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  30.37 
 
 
465 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
444 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  30.31 
 
 
452 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  29.87 
 
 
452 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  29.31 
 
 
449 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  34.41 
 
 
453 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.67 
 
 
449 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  33.26 
 
 
452 aa  186  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  33.73 
 
 
453 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  33.73 
 
 
453 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  31.39 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  29.56 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.27 
 
 
449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  30.38 
 
 
454 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  30.41 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
451 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  29.9 
 
 
438 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  33.08 
 
 
454 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.9 
 
 
458 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
452 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  29.72 
 
 
448 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  30.79 
 
 
458 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  29.79 
 
 
448 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  31.96 
 
 
457 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.45 
 
 
461 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  27.7 
 
 
452 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  30.89 
 
 
467 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  32.07 
 
 
450 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  27.03 
 
 
452 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  30.89 
 
 
467 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
454 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  30.14 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  30.94 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  32.13 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  30.67 
 
 
467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  30.02 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  30.93 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.33 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  32.07 
 
 
450 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  30.39 
 
 
447 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  27.93 
 
 
452 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  29.68 
 
 
461 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  30.46 
 
 
461 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  31.57 
 
 
451 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  30.19 
 
 
448 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  28.92 
 
 
452 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  28.67 
 
 
452 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  28.82 
 
 
452 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  28.82 
 
 
452 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  28.82 
 
 
452 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  29.95 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  28.82 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  30.68 
 
 
449 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  31.22 
 
 
455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  29.79 
 
 
445 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  28.31 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  28.31 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  27.73 
 
 
452 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  28.31 
 
 
452 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  29.26 
 
 
450 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  29 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  31.17 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  28.82 
 
 
452 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  28.25 
 
 
452 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
461 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>