121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3980 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  99.27 
 
 		 411 aa  773    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  86.5 
 
 		 400 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 405 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  56.09 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  48.78 
 
 		 423 aa  282  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 399 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 406 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 414 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  39.2 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  37.73 
 
 		 391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  36.87 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  31.67 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 452 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.86 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.39 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.54 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.8 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22.99 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.71 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  26.57 
 
 		 464 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.21 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  27.43 
 
 		 606 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 495 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  32.81 
 
 		 459 aa  46.6  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.73 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.82 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.86 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.54 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4045  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  28.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.54 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  30.07 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  21.39 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>