61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0641 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  62.95 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  44.92 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  44.2 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  44.89 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  46.18 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  45.53 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 423 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  36 
 
 		 399 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  35.9 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  37.46 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  26.95 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  27.91 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02321  MFS transporter Seo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01930)  28.98 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  31 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  31 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.19 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.19 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  25.89 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>