41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5067 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  100 
 
 		 395 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  61.52 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  58.04 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  56.38 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  56.35 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  51.72 
 
 		 391 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  52.29 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  45.22 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  39.43 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 423 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 432 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  32.35 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3530  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  31.82 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.43 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  27.18 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>