More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2676 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  859    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  68.06 
 
 
427 aa  623  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  31.07 
 
 
414 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  29.26 
 
 
420 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  28.71 
 
 
429 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  27.51 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  26.45 
 
 
411 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  26.45 
 
 
411 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  26.21 
 
 
400 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  25.29 
 
 
405 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  26.12 
 
 
406 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  27.47 
 
 
399 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
415 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
414 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  26.74 
 
 
410 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  27.97 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  24.37 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  24.38 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  23.8 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.2 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  24.07 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  26.34 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  27.4 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  28.21 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  26.15 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  26.54 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  26.54 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  26.54 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  23.89 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.23 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.9 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  24.77 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  23.45 
 
 
461 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.76 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.87 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  25.46 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  23.72 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25.1 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25.1 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.7 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  27.36 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  27.76 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.2 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.2 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  24.61 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  22.07 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  22.38 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.44 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  26.09 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  24.78 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  24.78 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  24.78 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  29.63 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.83 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  22.17 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.24 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  24.78 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  24.78 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  24.78 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  24.78 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  22.38 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  22.32 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  23.94 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  22.32 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3079  MFS family transporter  32.8 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  24.78 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  25.85 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  25.32 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  22.86 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  21.99 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  27.65 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  23.36 
 
 
478 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  27.65 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  26.2 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  24.55 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  22.08 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  22.82 
 
 
449 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  24.72 
 
 
526 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
429 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  27.34 
 
 
430 aa  67  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.94 
 
 
459 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>