139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1564 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  100 
 
 
400 aa  778    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  37.75 
 
 
420 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  35.64 
 
 
414 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 
417 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  31.92 
 
 
429 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
432 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  32.43 
 
 
411 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  32.36 
 
 
411 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  30.81 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  31.14 
 
 
400 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
414 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  30.15 
 
 
406 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  27.46 
 
 
405 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  27.09 
 
 
410 aa  103  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
423 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  29.21 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  27.91 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  29.75 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  29.3 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  28.06 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  29.44 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  29.31 
 
 
391 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  24.76 
 
 
449 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  25.18 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
455 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  25.12 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.73 
 
 
432 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  28.83 
 
 
431 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  24.73 
 
 
454 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  25.7 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  25.91 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  23.14 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  23.81 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  25.52 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  28.44 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  26.99 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  24.88 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  32.68 
 
 
458 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  24.57 
 
 
391 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  28.42 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 
474 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  28.42 
 
 
399 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  28.42 
 
 
399 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  25.76 
 
 
415 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  24.56 
 
 
453 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.11 
 
 
439 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
443 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  25.53 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
386 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  30.77 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.16 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.77 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.77 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  24.42 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  30.77 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  24.63 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  25 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  27.07 
 
 
542 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  28.87 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1536  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.03 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  35.48 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
473 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5692  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  29.58 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  26.43 
 
 
456 aa  44.7  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.62 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.67 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  30.07 
 
 
451 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  24.13 
 
 
452 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
446 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  35.97 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  24.13 
 
 
452 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  30.07 
 
 
451 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.68 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  25.16 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.59 
 
 
414 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  35.97 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  24.5 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  28.87 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  28.87 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.7 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84757 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>