96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3142 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  86.25 
 
 		 411 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  86.4 
 
 		 411 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  52.99 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  56.09 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 423 aa  292  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 		 414 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  40.32 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  39.7 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  37.04 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.83 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 427 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.25 
 
 		 434 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 433 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  28.72 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  21.97 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.86 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  33.59 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  23.38 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  27.07 
 
 		 464 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 422 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  24.19 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  31.16 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.85 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  24.6 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.69 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.69 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  30.12 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  28 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0530  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 490 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 513 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>