34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1673 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  49.14 
 
 		 393 aa  279  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  39.05 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  37.57 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 391 aa  186  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 391 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  34.88 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 405 aa  147  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 460 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>