42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2542 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  763    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  71.78 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  60.84 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  66.32 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  56.18 
 
 		 395 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  53.33 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  53.91 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  43.26 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  40.05 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 406 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  28.34 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 438 aa  43.1  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>