More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  99.52 
 
 		 415 aa  801    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  100 
 
 		 415 aa  805    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  65.99 
 
 		 404 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  53.52 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  33.42 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  31.67 
 
 		 406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  30.98 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  30.48 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  29.62 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  29.47 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  34.29 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  32.82 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  27.61 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  26.61 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  29.89 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.46 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  27.4 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  27.69 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  24.72 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  24.72 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  28.57 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  28.57 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  28.49 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4960  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>