More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4288 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  901    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  43.7 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 427 aa  349  6e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 		 431 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 430 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 430 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 454 aa  318  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  40 
 
 		 480 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  42.3 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  40 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  39.45 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  40.37 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  40.23 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 449 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 445 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  38.16 
 
 		 442 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 468 aa  292  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 		 449 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 489 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  33.03 
 
 		 424 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  28.99 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  33 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 429 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  29.21 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  30.7 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  29.21 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  29.21 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  29.21 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  29.21 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  27.64 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  27.64 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.8 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  28.25 
 
 		 433 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  30.43 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  29.1 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  29.1 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  29.1 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  30.13 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  29.45 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  28.94 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  28.94 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  29 
 
 		 472 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  29 
 
 		 472 aa  162  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  31.01 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  29.45 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  35.23 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>