More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6282 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
429 aa  860    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  59.76 
 
 
430 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  59.76 
 
 
430 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  59.76 
 
 
430 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  59.16 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  59.38 
 
 
430 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  59.23 
 
 
430 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  58.2 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  50.36 
 
 
433 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 
439 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  48.56 
 
 
424 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  47.13 
 
 
427 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
430 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 
436 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 
432 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 
454 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  46.53 
 
 
430 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 
426 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
431 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 
441 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 
453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
431 aa  349  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  44.32 
 
 
468 aa  349  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  42.11 
 
 
442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  41.87 
 
 
439 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  41.26 
 
 
445 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  41.18 
 
 
441 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  41.72 
 
 
441 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  40.71 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  40.71 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  41.61 
 
 
439 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  40.91 
 
 
442 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  42.04 
 
 
441 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  40.24 
 
 
441 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  40.97 
 
 
435 aa  316  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  42.23 
 
 
457 aa  315  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  41.01 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
479 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  38.28 
 
 
489 aa  293  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  40 
 
 
501 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  37.44 
 
 
411 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  35.49 
 
 
428 aa  256  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  35.41 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
434 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  34.23 
 
 
424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  35.62 
 
 
441 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
433 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
433 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  29.61 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  29.61 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.12 
 
 
424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  33.93 
 
 
435 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  31.54 
 
 
435 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
425 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  33.85 
 
 
430 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  33.33 
 
 
411 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  31.58 
 
 
429 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
430 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
430 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  31.78 
 
 
432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.02 
 
 
433 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.02 
 
 
434 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  30.02 
 
 
434 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  34.19 
 
 
440 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  30.89 
 
 
453 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  32.35 
 
 
432 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  31.11 
 
 
423 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  28.87 
 
 
434 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
453 aa  193  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  28.87 
 
 
434 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  28.87 
 
 
434 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  28.87 
 
 
434 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  28.87 
 
 
434 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
415 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  31.03 
 
 
433 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
430 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  29.64 
 
 
449 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  29.49 
 
 
433 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  30.75 
 
 
428 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  30.24 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  28.9 
 
 
432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  28.72 
 
 
433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  28.9 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  28.9 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  30.02 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  28.9 
 
 
432 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.85 
 
 
446 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  31.11 
 
 
423 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  29.16 
 
 
433 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  31.11 
 
 
423 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  29.85 
 
 
446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
443 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  31.96 
 
 
443 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  31.96 
 
 
423 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  29.31 
 
 
428 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  29.31 
 
 
428 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>