More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0037 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0043  major facilitator family transporter  85.04 
 
 		 448 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.768707  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0037  major facilitator family transporter  100 
 
 		 448 aa  898    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.729938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26820  major facilitator transporter  74.03 
 
 		 442 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  70.45 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 440 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.56 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.92 
 
 		 437 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  35.54 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  38.83 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.62 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  36.36 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 455 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.24 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  38.29 
 
 		 460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 435 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  35.52 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  35.52 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.59 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.43 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.43 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.43 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  35.04 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 442 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  35.24 
 
 		 437 aa  249  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  33.33 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  35.57 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  34.55 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  34.55 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4279  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0810486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  36.34 
 
 		 439 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  36.52 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  35.66 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 458 aa  246  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  35.58 
 
 		 439 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1438  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  36.43 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  36.43 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  36.18 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  36.18 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  35.78 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  36.18 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.18 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  35.19 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  36.18 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  35.68 
 
 		 465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  34.55 
 
 		 435 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.5 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  34.86 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 457 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  36.44 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  35.93 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  34.32 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  38.18 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  34.35 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  35.9 
 
 		 446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 459 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 449 aa  239  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  35.31 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  35.86 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>