238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3367 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
396 aa  738    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  62.5 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  51.87 
 
 
423 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  49.11 
 
 
405 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  50 
 
 
403 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  52.2 
 
 
412 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  52.2 
 
 
412 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  52.2 
 
 
412 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  54.69 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  43.48 
 
 
445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  47.84 
 
 
409 aa  262  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 
410 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  44.12 
 
 
413 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 
417 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
384 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
404 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  33.6 
 
 
424 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  34.13 
 
 
408 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  32.52 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  33.51 
 
 
427 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  33.51 
 
 
427 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  31.22 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  33.78 
 
 
427 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
437 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  32.07 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  31.91 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  30.28 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  31.06 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  24.75 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  25.9 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  25 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  26.99 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  25.57 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  25.57 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  25.57 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  25.59 
 
 
409 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  27.56 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.35 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  32.16 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  29.24 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  24.92 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  34.93 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  31.12 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  26.16 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  27.75 
 
 
463 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  27.75 
 
 
463 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  27.75 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  27.75 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  27.75 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  27.47 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  29.56 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  26.25 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.7 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.68 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  20.58 
 
 
456 aa  54.3  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  28.8 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  32.17 
 
 
436 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
433 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
415 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  34.42 
 
 
424 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.34 
 
 
429 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  27.84 
 
 
469 aa  53.1  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.99 
 
 
433 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  28.17 
 
 
416 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  33.77 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  23.9 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.33 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.33 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  33.77 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  23.81 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  27.8 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 
439 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  32.09 
 
 
437 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  35 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  33.61 
 
 
450 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  27.08 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  25.45 
 
 
433 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  27.78 
 
 
445 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
432 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  27.62 
 
 
917 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  28.23 
 
 
398 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.76 
 
 
457 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  22.88 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
433 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  33.99 
 
 
424 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>