257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2214 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  100 
 
 		 413 aa  776    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  55.39 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  40.61 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  41.93 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  40.15 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  42.9 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 397 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 423 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  23.34 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 461 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.3 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  22.3 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  22.3 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  32.81 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.77 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.56 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  23.81 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  21.58 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  29.26 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  24.07 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  26.97 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  30 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  27.98 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.93 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.06 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  24.36 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  24.42 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.34 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.34 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  26.03 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  26.03 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  25.48 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  22.63 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3978  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 461 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 449 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  25.24 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  27.72 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  26.69 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  26.69 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  22.16 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  28.33 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  0.00000000000905697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3900  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  28.95 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  27.68 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3837  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 461 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>