207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2858 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  88.39 
 
 		 424 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  92 
 
 		 427 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  92 
 
 		 427 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  96.71 
 
 		 425 aa  773    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  92 
 
 		 427 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  81.11 
 
 		 417 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  50.49 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  60.69 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  58.29 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  56.87 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  56.87 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  57.91 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  56.27 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  54.84 
 
 		 431 aa  289  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  52.4 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  34.56 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  31.9 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  29.83 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.88 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  30.12 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  26.28 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  20.68 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  28.24 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  20.72 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  20.44 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  19.55 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  19.55 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  19.55 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  19.31 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  20.19 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  25.12 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  29.49 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  19.75 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  19.69 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  20.94 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  24.48 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.08 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.08 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.08 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  25.97 
 
 		 917 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.08 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.08 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 219 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  23.84 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.57 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  25 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  26.29 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.55 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.36 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3033  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.822126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  27.6 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  25 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 		 449 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  25.9 
 
 		 485 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.93 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  25.64 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  30.77 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  25.13 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  25.13 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.51 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 440 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  30.77 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>