166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4825 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  794    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  794    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  54.68 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  61.73 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  57.07 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  57.35 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  56.01 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  57.18 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  61.81 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  56.86 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  62.59 
 
 		 433 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  56.56 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  54.38 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  58.82 
 
 		 431 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  31.39 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  38.54 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  29.17 
 
 		 445 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  32.7 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  28.95 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  24.06 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  25.33 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  29.87 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  25.33 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  26.4 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  25.25 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  26.53 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  26.53 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  28.21 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  29.72 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.42 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  30.36 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  28.02 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  28.4 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.57 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  35 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  35 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  23.4 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3821  major facilitator superfamily transporter  29.01 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  23.1 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.19 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  27.68 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  30.47 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.51 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.51 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  26.51 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 408 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.26 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.51 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.51 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  25 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>