239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4400 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  739    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  54.69 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  54.4 
 
 		 412 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  54.4 
 
 		 412 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  54.4 
 
 		 412 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  51.74 
 
 		 423 aa  332  8e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  46.91 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  52.6 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  41.24 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 417 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 425 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 437 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 461 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  22.58 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.8 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  23.16 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  31.23 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  27.1 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  23.81 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  22.96 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.08 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.08 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  25 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.76 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  24.32 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.04 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  20.36 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  20 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.34 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  23.27 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  24.36 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  22.5 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  25.37 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  18.12 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  23.27 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  22.91 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  23.27 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  22.91 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  22.55 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  22.74 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  22.74 
 
 		 449 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  22.74 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  22.74 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  22.55 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.05 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.76 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.02 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 534 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.37 
 
 		 449 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.44 
 
 		 483 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.53 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>