More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2202 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  816    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  58.31 
 
 
408 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  55.37 
 
 
409 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  55.77 
 
 
399 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  55.61 
 
 
414 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  55.12 
 
 
402 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  55.77 
 
 
404 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  54.84 
 
 
404 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  55.77 
 
 
404 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  55.53 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  54.68 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  44.91 
 
 
408 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
404 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  32.99 
 
 
411 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  30.62 
 
 
408 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  30.79 
 
 
415 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  30.79 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  33.33 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
380 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
392 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
384 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  22.89 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  23.83 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.17 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  21.61 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  20.26 
 
 
428 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  22.13 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  24.37 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.78 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.78 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  20.79 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  21.96 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
438 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  24.48 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  22.57 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  22.57 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  22.57 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  21.39 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  21.14 
 
 
438 aa  67  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  21.57 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  25.26 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  22.52 
 
 
436 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  21.57 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.56 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.3 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  22.52 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  22.33 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.23 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  22.52 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  22.19 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  22.52 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  22.19 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  20.51 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  21.61 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  24.71 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  20.67 
 
 
446 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  25.61 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.9 
 
 
440 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  23.25 
 
 
452 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  23.25 
 
 
452 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  22.15 
 
 
453 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  22.4 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  20.19 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  29.33 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  28.64 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  31.28 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.56 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.09 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  22.47 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  22.47 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.09 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
453 aa  60.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.31 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  23.14 
 
 
436 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  21.93 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.54 
 
 
432 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  24.16 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.14 
 
 
435 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  22.11 
 
 
452 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  22.11 
 
 
452 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  22.11 
 
 
452 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  22.11 
 
 
452 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  22.11 
 
 
452 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  19.63 
 
 
430 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  25.62 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  23.94 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  22.89 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  27.23 
 
 
418 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  20.69 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>