More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5417 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  814    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  53.62 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  53.52 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  53.52 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  33.77 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  32.49 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  32.34 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  32.34 
 
 		 404 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  31.74 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  31.23 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  34.09 
 
 		 411 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  27.89 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  28.37 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  27.32 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  27.32 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  27.23 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  24.6 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.63 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  27.51 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4960  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.33 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.7 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  25.28 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  22.81 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  27.37 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  22.81 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.5 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  29.7 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>