More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4960 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013746  Htur_4960  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  820    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.5 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1347  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.258837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  27.75 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  27.75 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  22.58 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.37 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.06 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  21.57 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.68 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3861  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  26.29 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  26.29 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  21.81 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  21.81 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  20.99 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  21.57 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.23 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  25.1 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  26.96 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25.1 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.97 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  24.02 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25.1 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  22.22 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  22.77 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  24.89 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  21.08 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  21.71 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  24.29 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  24.44 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.53 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  23.35 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  25.69 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>