More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0835 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  97.7 
 
 
434 aa  827    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  866    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  40.38 
 
 
432 aa  335  9e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  41.27 
 
 
445 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  36.34 
 
 
418 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  33.42 
 
 
428 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  34.48 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  34.6 
 
 
414 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
421 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  34.9 
 
 
434 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  33.33 
 
 
432 aa  229  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  33.94 
 
 
417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
425 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
415 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
441 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
411 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
437 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
439 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
446 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29.58 
 
 
434 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
421 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  27.53 
 
 
432 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  27.53 
 
 
432 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  29.57 
 
 
407 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  27.59 
 
 
426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  26.84 
 
 
426 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  27.68 
 
 
430 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  27.68 
 
 
430 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  27.84 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.71 
 
 
425 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  28.05 
 
 
443 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
395 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  30.23 
 
 
427 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
392 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  28.44 
 
 
412 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  31.79 
 
 
437 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  29.87 
 
 
422 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  31.46 
 
 
437 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  28.74 
 
 
443 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  28.57 
 
 
418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  28.2 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  27.37 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.71 
 
 
430 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.48 
 
 
430 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.16 
 
 
420 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  29.23 
 
 
420 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.65 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  23.69 
 
 
425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  23.46 
 
 
425 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  31.52 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  25.27 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  28.34 
 
 
439 aa  129  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  25.92 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25.27 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  27.18 
 
 
431 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  26.91 
 
 
431 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  25.67 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  23.68 
 
 
423 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.99 
 
 
384 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  26.21 
 
 
413 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1823  major facilitator transporter  27.25 
 
 
396 aa  124  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.262601  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  23.44 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  28.74 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  28.67 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  28.67 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  28.9 
 
 
412 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
430 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  28.91 
 
 
405 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
412 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  28.9 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  28.9 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  28.23 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  28.74 
 
 
412 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  24.94 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  24.94 
 
 
428 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  29.28 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  29.28 
 
 
410 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  35.16 
 
 
430 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  23.93 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  28.47 
 
 
410 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  24.42 
 
 
416 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  25.54 
 
 
411 aa  108  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.52 
 
 
430 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.08 
 
 
426 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  31.84 
 
 
425 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  31.84 
 
 
425 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  31.02 
 
 
440 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  31.58 
 
 
424 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  23.45 
 
 
434 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  28.79 
 
 
423 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
436 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
439 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.99 
 
 
430 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  23.77 
 
 
432 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>