More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3296 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  82.5 
 
 
409 aa  642    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  92 
 
 
402 aa  715    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  100 
 
 
404 aa  803    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  95.05 
 
 
406 aa  741    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  97.28 
 
 
404 aa  754    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  98.02 
 
 
404 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  99.5 
 
 
414 aa  800    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  100 
 
 
404 aa  803    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  83.25 
 
 
399 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  69.25 
 
 
408 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  55.77 
 
 
410 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  45.63 
 
 
408 aa  322  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  31.55 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
404 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  32.75 
 
 
407 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  32.41 
 
 
411 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  30.56 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  30.61 
 
 
415 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
392 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  23.88 
 
 
449 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
408 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.48 
 
 
446 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  22.98 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  21.2 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  22.73 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  23.21 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  21 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  21.58 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  22.16 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  22.16 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  23.06 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  22.8 
 
 
428 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  20.8 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  22.39 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.98 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  22.39 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  22.22 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  20.05 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  23.37 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  23.82 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  23.98 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  23.98 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  23.98 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  23.98 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  23.98 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  21.96 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  21.96 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  21.96 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  21.96 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  21.96 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  21.96 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  21.96 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  20.15 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  22.01 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  22.01 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  23 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  22.22 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  21.64 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  20 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  22.02 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  21.76 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  21.12 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  21.76 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  21.43 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  24.93 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  20.86 
 
 
463 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  22.81 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  22.81 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  22.81 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  22.81 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  22.81 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  22.54 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  22.81 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  22.81 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  21.79 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  21.33 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.08 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  20.59 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  20.59 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  21.45 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  22.81 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  21.45 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  21.81 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  21.45 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  22.41 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  20.33 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  21.84 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>