147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3886 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  845    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  56.1 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  59.76 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  58.35 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  60.28 
 
 		 425 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  67.54 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  58.41 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  58.41 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  57.6 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  60.43 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  60.43 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  60.42 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  67.96 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  61.95 
 
 		 433 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  54.12 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  33.82 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  33.67 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  37.25 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  28.75 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  28.92 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  30.03 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  19.04 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  18.52 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  19.01 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  19.01 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  19.01 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  19.3 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  27.69 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  18.52 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  25.41 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  21.15 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  19.75 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  32.24 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.37 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  27.91 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  21.73 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25.31 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 425 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.97 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.7 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  25.7 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  25.12 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  25.12 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  27.02 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  25.22 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  25.78 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.12 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  23.81 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4567  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  22.18 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.86 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>