More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1058 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
449 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  48.49 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  46.82 
 
 
424 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
436 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  42.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  42.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  42.73 
 
 
430 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  44.16 
 
 
427 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
439 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 
431 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  42.31 
 
 
429 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  43.42 
 
 
430 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  42.5 
 
 
430 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  42.27 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 
430 aa  356  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
454 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  40.95 
 
 
429 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 
432 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
449 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 
431 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  43.05 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  43.16 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  40.3 
 
 
468 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
453 aa  326  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
429 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  38.84 
 
 
441 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  37.7 
 
 
480 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  37.7 
 
 
441 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  39.68 
 
 
457 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  37.7 
 
 
441 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  40.98 
 
 
441 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  36.77 
 
 
439 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  36.87 
 
 
445 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  37.94 
 
 
442 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  36.18 
 
 
439 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  37 
 
 
441 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  36.41 
 
 
442 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  36.77 
 
 
432 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  37.34 
 
 
435 aa  269  8e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  34.15 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
479 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  36.52 
 
 
501 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  35.31 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  33.87 
 
 
411 aa  235  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  33.78 
 
 
428 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  32.89 
 
 
441 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
433 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
433 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 
420 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  32.89 
 
 
432 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  36.26 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  33.03 
 
 
424 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  31.12 
 
 
429 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
425 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  32.93 
 
 
430 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  31.54 
 
 
440 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.82 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  29.8 
 
 
434 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  29.8 
 
 
434 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  29.8 
 
 
434 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  29.8 
 
 
434 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  29.8 
 
 
434 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  29.13 
 
 
425 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  29.13 
 
 
425 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  30 
 
 
423 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  30.84 
 
 
435 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  30.19 
 
 
433 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  31.44 
 
 
411 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
430 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
425 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
430 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  29.37 
 
 
423 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  31.12 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
430 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  30.77 
 
 
432 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
436 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  30.32 
 
 
436 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.59 
 
 
436 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  29.6 
 
 
423 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  26.83 
 
 
433 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  28.64 
 
 
474 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.37 
 
 
436 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  29.6 
 
 
443 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.37 
 
 
436 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.37 
 
 
436 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  31.12 
 
 
436 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  30.04 
 
 
423 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  30.04 
 
 
423 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
415 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  30.61 
 
 
435 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  28.41 
 
 
433 aa  176  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
432 aa  176  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  27.98 
 
 
472 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  27.98 
 
 
472 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  27.92 
 
 
432 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  27.21 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  27.69 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>