More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0852 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  868    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  23.23 
 
 		 406 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.73 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.75 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  22.99 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  23.46 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  21.83 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  22.08 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  22.37 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  20.88 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  22.67 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  21.61 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  24.64 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.94 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  21.31 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  22.14 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  22.44 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  22.14 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  22.14 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  22.52 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  22.52 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  22.52 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  22.52 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  23.31 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  23.04 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  21.34 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  30.65 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  20.91 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  23.1 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3400  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  21.34 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  21.73 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  20.65 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  19.93 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  20.68 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  23.23 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  22.25 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  21.34 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  21.34 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  21.34 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  21.34 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  21.34 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  21.34 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  22.87 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  19.58 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  21.86 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  21.86 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  24.87 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  25 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  27.04 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>