More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1367 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  76.12 
 
 		 437 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  97.31 
 
 		 441 aa  858    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 446 aa  889    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  69.07 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  68.87 
 
 		 434 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  55.58 
 
 		 446 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  53.44 
 
 		 439 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  53.67 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  53.44 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  53.44 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  53.44 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  53.44 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  53.44 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  53.44 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  53.21 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  55.06 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  55.13 
 
 		 447 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  53.94 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  54.69 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  54.69 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  54.5 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  54.27 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  54.52 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  54.52 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  53.01 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  54.46 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  54.76 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  47.48 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  44.37 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  43.76 
 
 		 455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  43.54 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  38.46 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.365654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2547  regulatory protein UhpC  38.46 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  38.46 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  38.79 
 
 		 440 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2437  regulatory protein UhpC  38.54 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  34.55 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  34.62 
 
 		 449 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  34.09 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  33.86 
 
 		 449 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  33.41 
 
 		 445 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  34.2 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  34.2 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  34.4 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  35.55 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.26 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  33.26 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.26 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  35.38 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  33.26 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.26 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.26 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.26 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.03 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.03 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  33.64 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.49 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  32.48 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  32.48 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  33.49 
 
 		 454 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  34.32 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.18 
 
 		 448 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.56 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  32.56 
 
 		 444 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  32.27 
 
 		 449 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  34.39 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.18 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.72 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  34.2 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  33.33 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.27 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  33.33 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  33.09 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  33.09 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  33.09 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  33.33 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  33.33 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.05 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  34.28 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  34.28 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.33 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.8 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.64 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.1 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  30.21 
 
 		 448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  31.48 
 
 		 481 aa  226  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30179  MFS family transporter: hexose phosphate  36.77 
 
 		 507 aa  219  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0192578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>