More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2625 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
398 aa  759    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 
408 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  59.22 
 
 
219 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3976  major facilitator superfamily transporter  46.28 
 
 
125 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.55 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  28.35 
 
 
411 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.33 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
438 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  25.31 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  27.94 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  27.13 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  28.8 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.05 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  24.3 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  23.86 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  24.05 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  24.05 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  24.42 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.3 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  22.47 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.8 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.13 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
460 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  23.87 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  23.24 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  23.79 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  29.2 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  21.79 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  22.05 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  21.79 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.59 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  22.05 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  21.79 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  22.05 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  21.79 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.97 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.84 
 
 
452 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.74 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
439 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.32 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  23.87 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  29.73 
 
 
437 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.62 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.7 
 
 
427 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.24 
 
 
439 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.24 
 
 
439 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.24 
 
 
439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  25.07 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  27.07 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.98 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  27.67 
 
 
433 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  25.66 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
400 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  25.3 
 
 
428 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.28 
 
 
436 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3033  major facilitator transporter  26.99 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.822126  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.7 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.86 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.69 
 
 
429 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.93 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.93 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.93 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  24.36 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.62 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.24 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  27.39 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  29.41 
 
 
411 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  22.5 
 
 
434 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.37 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  24.72 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  27.35 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  27.76 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  28.25 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  27.06 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  25.75 
 
 
425 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  26.49 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  26.98 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  26.15 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 
425 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.7 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
420 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
441 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>